30.04.2010
Žabí genom
Vědci publikovali první kompletní genomovou sekvenci obojživelníkaV současné době již byl genom osekvenován u celé řady živočichů. Připomeňme třeba potkana, octomilku (Drosophila melanogaster), šimpanze, psa domácího, nebo hlístici druhu Caenorhabditis elegans (viz seznam dosud osekvenovaných organizmů). Podrobně osekvenovaný genom zástupce z třídy obojživelníků (Amphibia) však zatím chyběl.
Nyní vědci představují kompletní sekvenci africké žáby druhu Xenopus tropicalis. Částečná sekvence tohoto druhu byla známa již určitou dobu, ovšem teprve nyní byla získána sekvence kompletní. Své výsledky zveřejnila skupina amerických vědců v nejnovějším čísle prestižního časopisu Science.
Rod Xenopus zahrnuje přes dvacet druhů žab z oblasti subsaharské Afriky. Ve známost vešly mimo jiné také pro svou citlivost k působení HCG (lidského choriového gonadotropinu). V období po druhé světové válce tak byly například v USA používány jako "těhotenský test" – pokud byla žena těhotná, potom žába zareagovala na injekci vzorku ženské moči ovulací.
Genom druhu Xenopus tropicalis obsahuje zhruba 20 000 genů, lokalizovaných na 10 párech chromozomů. Části genomu tohoto druhu jsou navíc evolučně velmi staré, snad až 360 miliónů let. Mapování tak umožňuje vědcům dokonce částečně nahlédnout do historie a přináší nové informace do oboru evoluční biologie. Velký význam má sekvenece tohoto genomu i proto, že příbuzný druh Xenopus laevis je hojně využíván jako modelový organismus ve studiích embryonálního vývoje a v buněčné biologii. Navíc genom této žáby obsahuje i řadu genů, které se vyskytují i u člověka a to v asociaci s různými nemocemi. Výsledky této práce tak mohou mít i určitý dopad na klinickou genetiku.
Článek přinesl server ScienceDaily
Text původního článku v časopisu Science
